•  
  • Technológie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
    Real-Time PCR Real-Time PCR
    10x Genomics 10x Genomics
  • Produkty
    Prístroje
    • Sekvenátory NGS
    • Skenery čipov
    • Sonikátory
    • Chromium X séria
    • Chromium Connect
    • Sonikátor M220
    • Sonikátor ML230
    • RT-PCR systém
    • Farbiace automaty
    • Xenium Analyzer
    Reagencie
    • PCR reagencie
    • RT-PCR kity
    • Sekvenačné kity
    • Kity pre prípravu NGS knižníc
    • Transfekčné činidlá
    • Illumina Long-Read Technológie
    Software
    • BaseSpace Sequence Hub
    • Illumina Connected Analytics
    • Local Run Manager
    • TruSight Software Suite
    • DRAGEN Bio-IT Platform
    Ostatné produkty
    • Repirátor N95
  • Diagnostika
    Real-Time PCR
    • Trombofilné mutácie
    • DIOS – priama detekcia SARS-CoV-2
    • EurobioPlex SARS-CoV-2 Multiplex
    • RealStar panel pre enterické ochorenia
    • RealStar panel pre respiračné ochorenia
    • RealStar panel pre imunodeficientných pacientov
    • RealStar panel pre tropické ochorenia
    • RealStar panel pre vírusy prenášané krvou
    NGS
    • Celogenómové sekvenovanie
    • VeriSeq
    • LymphoTrack
    • TruSight Myeloid Sequencing Panel
    • TruSight Hereditary Cancer Panel
    • Respiratory Pathogen Panel
    • AmpliSeq for Illumina Focus Panel
    • Illumina TruSight Cardio Sequencing Kit
    • Illumina TruSight Inherited Disease Sequencing Panel
    • Illumina TruSight One Sequencing Panels
    • TruSight Oncology 500
    • TruSight Tumor 15
    • Illumina Celoexómové sekvenovanie
    • Custom panely DNA/ RNA
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    • TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD)
    Microarrays
    • Kity pre čipové analýzy
    • Global Diversity Array (GDA Cyto) a Global Screening Array (GSA Cyto)
    Ostatné metódy
    • Antigénne testy na detekciu COVID-⁠19
    • Perinatálna diagnostika
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    Diagenode
    IAB
    IBA
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Thermo Scientific
    Verogen
    Vitrolife
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Obchodné oddelenie Obchodné oddelenie
    Aplikačná podpora Aplikačná podpora
    Servisné oddelenie Servisné oddelenie
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha
Úvod > Produkty > Reagencie > Kity pre prípravu NGS knižníc > COVIDSeq Test

COVIDSeq test - Illumina

COVIDSeq test od spoločnosti Illumina bol navrhnutý tak, aby umožňoval časovo i finančne nenáročnú detekciu a charakterizáciu subtypov SARS-CoV-2. Tieto dáta sú nevyhnutné pre identifikáciu nových subtypov, prevalenciu všetkých subtypov v rámci danej populácie, napomáhajú zistiť cesty prenosu daného subtypu, a tým poskytnúť dáta pre komplexnú “surveillance” štúdiu. Sledovanie týchto nových subtypov je doležité taktiež pre sledovanie adaptácie vírusu a jeho mutačnej rýchlosti, čo je podkladom pre úspešný priebeh vakcinácie.

Dizajn testu je založený na validovanej verzii verejne dostupného ARTIC multiplex PCR protokolu s 98 amplikónmi (v 2 pooloch) určenými na amplifikáciu špecifických vírusových sekvencií SARS-CoV-2. Súčasťou COVIDSeq protokolu je i 11 ľudských mRNA, ktoré slúžia ako interná kontrola. Kombinácia tohto dizajnu a osvedčenej technológie Illumina ponúka dosiahnutie maximálneho pokrytia celého genómu a detekciu i nových variant s vysokou presnosťou. 

 

Vstupným materiálom protokolu je izolát RNA, ktorá je následne prepísaná do cDNA (kit obsahuje reagencie potrebné pre tento krok) v procese reverznej transkripcie, nasleduje PCR amplifikácia s COVIDSeq primermi, príprava knižníc s využitím BLT technológie. Pripravené knižnice je možné sekvenovať na všetkých platformách Illumina, pričom protokol bol spoločnosťou Illumina validovaný len pre platformy NovaSeq 6000 , NextSeq 500/550/550 Dx (v móde RUO – “research use only”) a NextSeq 2000 . Umožňuje značnú flexibilitu v počte analyzovaných vzoriek od 384 až po 3072 vzoriek za približne 12 hodín.

Súčasťou riešenia je i analýza dát z validovaných platforiem prostredníctvom aplikácie DRAGEN COVIDSeq Test (RUO), ktorá poskytuje informáciu o prítomnosti SARS-CoV-2 a generuje jeho sekvencie vo formáte FASTA. V prípade validovaných i nevalidovaných sekvenátorov je možné využitie aplikácie DRAGEN COVID Lineage , ktorá reportuje pokrytie cieľových oblastí, vykonáva detekciu a generovanie sekvencií a prostredníctvom spolupracujúcich aplikácií 

Pangolin a NextClade  ponúka priradenie rodových línií pre zistené mutácie a vytváranie fylogenetických stromov.  

 

Viac informácií nájdete na stránkach výrobcu

Súvisiace odkazy

Respiratory Virus Oligo Panel V2 - Illumina

Detekcia subtypov SARS-CoV-2 ďalších koinfekcií.

Sekvenátory NGS

NextSeq 1000/2000 - Illumina

Mnoho inovácií a väčšia flexibilita sekvenovania

NextSeq 550 - Illumina

Spojenie aplikácií vysokapacitného sekvenovania a skenovania čipov

NovaSeq 6000 - Illumina

Najvyšší sekvenačný výkon na trhu

COVIDSeq Test
Logo Illumina

Vyžiadať informácie o:

COVIDSeq Test

Božena Bollová Regionálna manažérka Genetica s.r.o. +421 917 334 151 bollova@genetica-group.com Genetica s.r.o.


Kontaktný formulár

Údaje s hviezdičkou
sú povinné
Copyright © 2023 GeneTiCA s.r.o. +421 907 373 757 | genetica@genetica.sk