Microarray technológia od spoločnosti Illumina ponúka pomocou špeciálnych čipov možnosť analyzovať tisíce vzoriek za účelom identifikácie bodových mutácií, štrukturálnych variantov či zmien génovej expresie a metylácie. K dispozícii je viacero typov čipov, od komerčne dostupných, po konzorciové, ktoré sú obmedzene dostupné po splnení podmienok daného konzorcia, semi-customizované a customizované, ktoré si užívateľ nadizajnuje podľa vlastných potrieb pomocou DesignStudio Microarray Assay Designer.
Ďalší spôsob kategorizácie čipov je na základe aplikácie, kedy možno čipy rozdeliť na celogenómové, exómové, metylačné, či targetované. Zároveň čipy delíme podľa druhov analyzovaných organizmov na 2 základné kategórie: human a non-human.