•  
  • Technológie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
    Real-Time PCR Real-Time PCR
    10x Genomics 10x Genomics
  • Produkty
    Prístroje
    • Sekvenátory NGS
    • Skenery čipov
    • Sonikátory
    • Chromium X séria
    • Chromium Connect
    • Sonikátor M220
    • Sonikátor ML230
    • RT-PCR systém
    • Farbiace automaty
    • Xenium Analyzer
    Reagencie
    • PCR reagencie
    • RT-PCR kity
    • Sekvenačné kity
    • Kity pre prípravu NGS knižníc
    • Transfekčné činidlá
    • Illumina Long-Read Technológie
    Software
    • BaseSpace Sequence Hub
    • Illumina Connected Analytics
    • Local Run Manager
    • TruSight Software Suite
    • DRAGEN Bio-IT Platform
    Ostatné produkty
    • Repirátor N95
  • Diagnostika
    Real-Time PCR
    • Trombofilné mutácie
    • DIOS – priama detekcia SARS-CoV-2
    • RealStar panel pre enterické ochorenia
    • RealStar panel pre respiračné ochorenia
    • RealStar panel pre imunodeficientných pacientov
    • RealStar panel pre tropické ochorenia
    • RealStar panel pre vírusy prenášané krvou
    NGS
    • Celogenómové sekvenovanie
    • VeriSeq
    • LymphoTrack
    • TruSight Myeloid Sequencing Panel
    • TruSight Hereditary Cancer Panel
    • Respiratory Pathogen Panel
    • AmpliSeq for Illumina Focus Panel
    • Illumina TruSight Cardio Sequencing Kit
    • Illumina TruSight Inherited Disease Sequencing Panel
    • Illumina TruSight One Sequencing Panels
    • TruSight Oncology 500
    • TruSight Tumor 15
    • Illumina Celoexómové sekvenovanie
    • Custom panely DNA/ RNA
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    • TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD)
    Microarrays
    • Kity pre čipové analýzy
    • Global Diversity Array (GDA Cyto) a Global Screening Array (GSA Cyto)
    Ostatné metódy
    • Antigénne testy na detekciu COVID-⁠19
    • Perinatálna diagnostika
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    Diagenode
    IAB
    IBA
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Thermo Scientific
    Verogen
    Vitrolife
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Obchodné oddelenie Obchodné oddelenie
    Aplikačná podpora Aplikačná podpora
    Servisné oddelenie Servisné oddelenie
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha

JAK SOUBORY COOKIES FUNGUJÍ?

Při návštěvě webových stránek je velmi pravděpodobné, že stránka získá nebo uloží informace ve vašem prohlížeči a to ve formě souborů cookies. Nad soubory máte plnou kontrolu, ale jsou velmi důležité pro správné fungování webu. Mohou to být informace o vašich preferencích, zájmech o produkty, přizpůsobení prostředí a chování webu. V neposlední řadě obsahují data, která využíváme pro kontinuální zlepšování webu a našich služeb. Stále respektujeme vaše právo na soukromí, a proto se můžete rozhodnout, že se sběrem souborů cookies nebudete souhlasit.Nezapomínejte na to, že blokování některých souborů cookies můžete ovlivnit, jak stránka funguje a jaké služby jsou vám nabízeny.


Úvod > Diagnostika > NGS > AmpliSeq for Illumina Focus Panel

AmpliSeq for Illumina Focus Panel - Illumina

AmpliSeq for Illumina Focus Panel je riešenie pre cielené resekvenovanie vybraných kľúčových biomarkerov  52 génov so známym významom pre solídne nádory, ako napr. nádory pľúc, hrubého čreva, vaječníkov, prostaty, prsníka a melanómu. Pomocou tohto panelu je možné analyzovať DNA aj RNA súčasne. Rýchlo a efektívne je možné detegovať nukleotidové varianty - SNV  („single nucleotide variants“), inzercie, delécie a CNV („copy number variants“) vo vzorkách DNA a fúzie génov vo vzorkách RNA.

Protokol zahŕňa prípravu knižnice na báze PCR, sekvenovanie špeciálnou Illumina SBS („sequencing by synthesis“) technológiou a automatickú analýzu dát. Výsledné dáta je možné analyzovať lokálne pomocou softvéru Local Run Manager alebo cloudovo pomocou platformy BaseSpace Sequence Hub, ktorá poskytuje prístup k BaseSpace Variant Interpreter.

 

Základné špecifikácie k AmpliSeq for Illumina Focus panelu:

  • Obsahuje spolu 553 amplikónov v 2 pooloch (DNA pool: 269 amplikónov, RNA pool: 284 amplikónov)
  • Cieli na 52 onkogénov
  • Príprava knižnice trvá 5-6 hodín
  • Množstvo vstupného materiálu: 1-10 ng
  • Kompatibilný s FFPE vzorkami
  • Kompatibilný s Illumina sekvenátormi: iSeq 100, MiniSeq, MiSeq

 

Sekvenačný kit

Počet vozriek/ experiment

Doba sekvenovania

Minimálna hĺbka pokrytia

Dĺžka čítania

iSeq 100 Reagent kit

8

17 hod.

500x

2x150 bp

MiniSeq Mid-output kit

16

17 hod.

500x

2x150 bp

MiniSeq High-output kit

48

24 hod.

500x

2x150 bp

MiSeq v2 Micro kit

8

19 hod.

500x

2x150 bp

MiSeq v2 kit

30

24 hod.

500x

2x150 bp

MiSeq v3 kit

48

32 hod.

500x

2x150 bp

 

Zoznam génov zachytávaných pomocou AmpliSeq for Illumina Focus panelu:

DNA pool

AKT1

EGFR

FGFR4

JAK3

MYCN

ALK

ERBB2

GNA11

KIT

NRAS

AR

ERBB3

GNAQ

KRAS

PDGFRA

BRAF

ERBB4

HRAS

MAP2K1

PIK3CA

CCND1

ESR1

IDH1

MAP2K2

RAF1

CDK4

FGFR1

IDH2

MET

RET

CDK6

FGFR2

JAK1

MTOR

ROS1

CTNNB1

FGFR3

JAK2

MYC

SMO

DDR2

 

 

 

 

 

RNA pool

ABL1

EGFR

ETV5

NTRK1

PPARG

ALK

ERBB2

FGFR1

NTRK2

RAF1

AKT3

ERG

FGFR2

NTRK3

RET

AXL

ETV1

FGFR3

PDGFRA

ROS1

BRAF

ETV4

MET

 

 

 

Viac informácii nájdete tu a tu 

AmpliSeq for Illumina Focus Panel
Logo Illumina

Vyžiadať informácie o:

AmpliSeq for Illumina Focus Panel

Božena Bollová Regionálna manažérka Genetica s.r.o. +421 917 334 151 bollova@genetica-group.com Genetica s.r.o.


Kontaktný formulár

Údaje s hviezdičkou
sú povinné
Copyright © 2023 GeneTiCA s.r.o. +421 907 373 757 | genetica@genetica.sk