•  
  • Technológie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
    Real-Time PCR Real-Time PCR
    10x Genomics 10x Genomics
  • Produkty
    Prístroje
    • Sekvenátory NGS
    • Skenery čipov
    • Sonikátory
    • Chromium X séria
    • Chromium Connect
    • Sonikátor M220
    • Sonikátor ML230
    • RT-PCR systém
    • Farbiace automaty
    • Xenium Analyzer
    Reagencie
    • PCR reagencie
    • RT-PCR kity
    • Sekvenačné kity
    • Kity pre prípravu NGS knižníc
    • Transfekčné činidlá
    • Illumina Long-Read Technológie
    Software
    • BaseSpace Sequence Hub
    • Illumina Connected Analytics
    • Local Run Manager
    • TruSight Software Suite
    • DRAGEN Bio-IT Platform
    Ostatné produkty
    • Repirátor N95
  • Diagnostika
    Real-Time PCR
    • Trombofilné mutácie
    • DIOS – priama detekcia SARS-CoV-2
    • RealStar panel pre enterické ochorenia
    • RealStar panel pre respiračné ochorenia
    • RealStar panel pre imunodeficientných pacientov
    • RealStar panel pre tropické ochorenia
    • RealStar panel pre vírusy prenášané krvou
    NGS
    • Celogenómové sekvenovanie
    • VeriSeq
    • LymphoTrack
    • TruSight Myeloid Sequencing Panel
    • TruSight Hereditary Cancer Panel
    • Respiratory Pathogen Panel
    • AmpliSeq for Illumina Focus Panel
    • Illumina TruSight Cardio Sequencing Kit
    • Illumina TruSight Inherited Disease Sequencing Panel
    • Illumina TruSight One Sequencing Panels
    • TruSight Oncology 500
    • TruSight Tumor 15
    • Illumina Celoexómové sekvenovanie
    • Custom panely DNA/ RNA
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    • TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD)
    Microarrays
    • Kity pre čipové analýzy
    • Global Diversity Array (GDA Cyto) a Global Screening Array (GSA Cyto)
    Ostatné metódy
    • Antigénne testy na detekciu COVID-⁠19
    • Perinatálna diagnostika
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    Diagenode
    IAB
    IBA
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Thermo Scientific
    Verogen
    Vitrolife
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Obchodné oddelenie Obchodné oddelenie
    Aplikačná podpora Aplikačná podpora
    Servisné oddelenie Servisné oddelenie
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha

JAK SOUBORY COOKIES FUNGUJÍ?

Při návštěvě webových stránek je velmi pravděpodobné, že stránka získá nebo uloží informace ve vašem prohlížeči a to ve formě souborů cookies. Nad soubory máte plnou kontrolu, ale jsou velmi důležité pro správné fungování webu. Mohou to být informace o vašich preferencích, zájmech o produkty, přizpůsobení prostředí a chování webu. V neposlední řadě obsahují data, která využíváme pro kontinuální zlepšování webu a našich služeb. Stále respektujeme vaše právo na soukromí, a proto se můžete rozhodnout, že se sběrem souborů cookies nebudete souhlasit.Nezapomínejte na to, že blokování některých souborů cookies můžete ovlivnit, jak stránka funguje a jaké služby jsou vám nabízeny.


Úvod > Diagnostika > NGS > Celogenómové sekvenovanie

Celogenómové sekvenovanie - Illumina

Sekvenovanie celého genómu (WGS) je komplexná metóda na analýzu celých genómov. Poznanie genómových informácií pomáha pri identifikácii dedičných chorôb, charakterizácii mutácií, či sledovaní ohnísk nákaz. Rapídne zníženie nákladov na sekvenovanie a schopnosť produkovať veľké množstvá dát robia z WGS silný nástroj pre genomický výskum.

Výhody WGS:

  • Poskytuje informácie o celom genóme vo vysokom rozlíšení
  • Zachytáva veľké i malé varianty
  • V krátkom čase poskytuje veľké objemy dát
  • Poskytuje komplexný pohľad na genóm
  • Je ideálny pre identifikáciu príčinných variantov a zostavenie nového genómu

Aj napriek tomu, že je táto metóda spájaná najmä so sekvenovaním ľudského genómu, vďaka vysokej flexibilite ju možno využiť aj na akékoľvek iné druhy organizmov. Základne možno WGS rozdeliť na:

Sekvenovanie veľkých genómov

Sekvenovanie malých genómov

De Novo sekvenovanie

Sekvenovanie ľudského genómu

Sekvenovanie veľkých genómov, t.j. väčších než 5 Mb, poskytuje cenné informácie o chorobách a má význam pri populačných štúdiách. Vedci často používajú sekvenovanie celého genómu na analýzu nádorov, vyšetrovanie príčin zárodočných chorôb, výber rastlín a zvierat vhodných pre šlachtiteľské programy a v neposlednom rade pre identifikáciu bežných genetických variantov medzi populáciami. Na sekvenovanie veľých genómov slúžia sekvenátory NovaSeq 6000 a NextSeq 1000/2000 

Sekvenovanie malých genómov (≤ 5 Mb) zahŕňa sekvenovanie genómov baktérií, vírusov a iných mikróbov. Môže byť užitočné z hľadiska molekulárnej epidemiológie či metagenomiky životného prostredia. Pre sekvenovanie takýchto malých genómov sú ideálnymi platformami: iSeq, MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 či NextSeq 1000/2000.

De novo sekvenovaním označujeme sekvenovanie nových genómov, pri ktorých nie je k dispozícii žiadna referenčná sekvencia na porovnanie. Poskytuje užitočné informácie pre mapovanie genómov nových organizmov alebo aj informácie pre konečnú úpravu genómov známych organizmov. Pri de novo sekvenovaní sa najčastejšie využívajú sekvenačné platformy (závisí od veľkosti genómu): iSeq 100, MiSeq a NovaSeq 6000.

Sekvenovanie celého ľudského genómu ponúka najpodrobnejší pohľad na náš genetický kód. WGS má schopnosť vyhodnotiť každú bázu v genóme a orientovať sa v zložitosti genómových variantov, ktoré nás robia jedinečnými. Kedysi išlo o náročnú aplikáciu, no dnes patrí sekvenovanie celého genómu človeka medzi jednu z najjednoduchších. Pokroky v príprave knižníc, sekvenovaní, bioinformatike a analýze variantov umožňujú získanie výsledných dát za menej ako 30 hodín. Sekvenovanie ľudského genómu patrí medzi najkomplexnejšie aplikácie, ktoré umožňujú detekciu rôznych variantov v jednom protokole, od malých zmien v jednom nukleotide po veľké chromozómové prešmyky. Na sekvenovanie ľudského genómu slúži platforma NovaSeq 6000

 

Viac informácii nájdete na stránkach výrobcu

  • TruSeq DNA PCR-Free Prep
  • Illumina DNA Prep
  • Illumina DNA PCR-Free Prep
  • Nextera XT DNA Library Prep
  • TruSeq DNA Nano

TruSeq DNA PCR-Free Prep

Doba prípravy:  5 hod.
Množstvo vstupnej vzorky: 1 ug DNA
Druh vstupného materiálu: gDNA
Veľkosť inzertu: 350-550 bp
Mechanizmus: mechanická fragmentácia 
Aplikácia: WGS, shotgun sekvenovanie, genotypizácia

 

Illumina DNA Prep

Doba prípravy:  3-4 hod.
Množstvo vstupnej vzorky: malé genómy: 1-500 ng DNA, veľké genómy: 100-500 ng DNA
Druh vstupného materiálu: gDNA, krv, sliny, plazmidy, bakteriálne kolónie
Veľkosť inzertu: 350 bp
Mechanizmus: BLT technológia 
Aplikácia: WGS, shotgun sekvenovanie, de novo sekvenovanie, amplikónové sekvenovanie

 

Illumina DNA PCR-Free Prep

Doba prípravy:  1,5 hod.
Množstvo vstupnej vzorky: 25-300 ng DNA
Druh vstupného materiálu: gDNA, krv, sliny
Veľkosť inzertu: 450 +/- 75 bp
Mechanizmus: BLT technológia
Aplikácia: WGS, de novo sekvenovanie

 

Nextera XT DNA Library Prep

Doba prípravy:  5,5 hod.
Množstvo vstupnej vzorky: 1 ng DNA
Druh vstupného materiálu: vzorky s malým inputom, „single cells“
Veľkosť inzertu: 300 bp -1,5 kb
Mechanizmus: enzymatická fragmentácia
Aplikácia: WGS, shotgun sekvenovanie, de novo sekvenovanie, amplikónové sekvenovanie, 16S rRNA sekvenovanie

 

TruSeq DNA Nano

Doba prípravy:

6 hod.

Množstvo vstupnej vzorky:

100 ng DNA

Druh vstupného materiálu:

 vzorky s malým inputom

Veľkosť inzertu:

350-550 bp

Mechanizmus:

mechanická fragmentácia

Aplikácia:

WGS, shotgun sekvenovanie, genotypizácia

 

Logo Illumina

Vyžiadať informácie o:

Celogenómové sekvenovanie

Monika Böhmerová Obchodná manažérka Genetica s.r.o. +421 908 708 999 bohmerova@genetica-group.com Genetica s.r.o.


Kontaktný formulár

Údaje s hviezdičkou
sú povinné
Copyright © 2023 GeneTiCA s.r.o. +421 907 373 757 | genetica@genetica.sk