iSeq 100 - Illumina

So sekvenačným systémom iSeq 100 je sekvenovanie novej generácie omnoho jednuduchšie a cenovo dostupnejšie ako kedykoľvek predtým. Nový systém iSeq 100 kombinuje CMOS („complementary metal-oxide semiconductor“) technológiu s overenou presnosťou Illumina SBS ( („sequencing by synthesis“) technológie, a tým poskytuje rýchle a presné sekvenačné dáta. Je ideálnym riešením pre realizáciu nezávislých sekvenačných analýz malého rozsahu.

Výstup systému iSeq 100 je až 1,2 Gb dát, resp. 4 milióny čítaní počas jedného experimentu trvajúceho 19 hodín. iSeq 100 využíva osvedčenú SBS technológiu, vďaka ktorej generuje vysoko kvalitné dáta so skóre kvality Q30, čo znamená, že len 1 z 1 000 báz môže byť priradená nesprávne. Klastrovanie a sekvenovanie prebieha v nanojamôčkach, ktoré sú sučasťou paternovanej flow cell. Súčasťou flow cell je aj CMOS čip, ktorý zabezpečuje súčasnú detekciu priradených báz. Inovatívna jednokanálová chémia využíva len jednu fluorescenčnú farbičku a dva chemické kroky s dvomi snímkami počas sekvenačného cyklu.

Intuitívne užívateľské rozhranie poskytuje pokyny v každom kroku nastavenia a spustenia experimentu. Jednoduchá a rýchla analýza dát môže prebiehať priamo na prístroji pomocou integrovaného serveru Local Run Manager, ktorý umožňuje spustenie experimentu a sledovanie jeho priebehu priamo na prístrojovom počítači alebo na vzdialenom počítači pripojenom na rovnakú sieť. Alternatívou je využitie cloudového riešenia. Sekvenačné dáta je taktiež možné preniesť na BaseSpace Sequence Hub, kde je možná ich následná analýza a úschova. Jednoduchá údržba prístroja je zabezpečená obsiahnutím všetkých reagencií v rámci jednej cartridge, ktorá slúži len na jedno použitie. V samotnom prístroji sa fluidika nenachádza, čo eliminuje kontamináciu medzi experimentami a nevyžaduje žiadne premývanie.

Vzhľadom k vysokému rozlíšeniu a mimoriadnej citlivosti umožňuje systém iSeq 100 širokú škálu aplikácií:

• Celogenómové sekvenovanie malých genómov
• Cielené resekvenovanie
• De Novo sekvenovanie
• AmpliSeq pre cielené resekvenovanie
• Sekvenovanie amplikónov
• Metagenomika – protokoly 16S rRNA a ITS
• Targetované mRNA sekvenovanie
• Sekvenovanie malých RNA

Viac informácií nájdete na stránkach výrobcu: iSeq 100