•  
  • Technológie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
    Real-Time PCR Real-Time PCR
    10x Genomics 10x Genomics
  • Produkty
    Prístroje
    • Sekvenátory NGS
    • Skenery čipov
    • Sonikátory
    • Chromium X séria
    • Chromium Connect
    • Sonikátor M220
    • Sonikátor ML230
    • RT-PCR systém
    • Farbiace automaty
    • Xenium Analyzer
    Reagencie
    • PCR reagencie
    • RT-PCR kity
    • Sekvenačné kity
    • Kity pre prípravu NGS knižníc
    • Transfekčné činidlá
    • Illumina Long-Read Technológie
    Software
    • BaseSpace Sequence Hub
    • Illumina Connected Analytics
    • Local Run Manager
    • TruSight Software Suite
    • DRAGEN Bio-IT Platform
    Ostatné produkty
    • Repirátor N95
  • Diagnostika
    Real-Time PCR
    • Trombofilné mutácie
    • DIOS – priama detekcia SARS-CoV-2
    • RealStar panel pre enterické ochorenia
    • RealStar panel pre respiračné ochorenia
    • RealStar panel pre imunodeficientných pacientov
    • RealStar panel pre tropické ochorenia
    • RealStar panel pre vírusy prenášané krvou
    NGS
    • Celogenómové sekvenovanie
    • VeriSeq
    • LymphoTrack
    • TruSight Myeloid Sequencing Panel
    • TruSight Hereditary Cancer Panel
    • Respiratory Pathogen Panel
    • AmpliSeq for Illumina Focus Panel
    • Illumina TruSight Cardio Sequencing Kit
    • Illumina TruSight Inherited Disease Sequencing Panel
    • Illumina TruSight One Sequencing Panels
    • TruSight Oncology 500
    • TruSight Tumor 15
    • Illumina Celoexómové sekvenovanie
    • Custom panely DNA/ RNA
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    • TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD)
    Microarrays
    • Kity pre čipové analýzy
    • Global Diversity Array (GDA Cyto) a Global Screening Array (GSA Cyto)
    Ostatné metódy
    • Antigénne testy na detekciu COVID-⁠19
    • Perinatálna diagnostika
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    Diagenode
    IAB
    IBA
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Thermo Scientific
    Verogen
    Vitrolife
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Obchodné oddelenie Obchodné oddelenie
    Aplikačná podpora Aplikačná podpora
    Servisné oddelenie Servisné oddelenie
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha

JAK SOUBORY COOKIES FUNGUJÍ?

Při návštěvě webových stránek je velmi pravděpodobné, že stránka získá nebo uloží informace ve vašem prohlížeči a to ve formě souborů cookies. Nad soubory máte plnou kontrolu, ale jsou velmi důležité pro správné fungování webu. Mohou to být informace o vašich preferencích, zájmech o produkty, přizpůsobení prostředí a chování webu. V neposlední řadě obsahují data, která využíváme pro kontinuální zlepšování webu a našich služeb. Stále respektujeme vaše právo na soukromí, a proto se můžete rozhodnout, že se sběrem souborů cookies nebudete souhlasit.Nezapomínejte na to, že blokování některých souborů cookies můžete ovlivnit, jak stránka funguje a jaké služby jsou vám nabízeny.


Úvod > Diagnostika > NGS > Respiratory Pathogen Panel

Respiratory Pathogen Panel - Illumina

Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit od spoločnosti Illumina je panel založený na NGS („Next Generation Sequencing“) technológii. Poskytuje vysoko citlivé a komplexné informácie o detekcii kritických patogénov a antimikrobiálnej rezistencii (AMR). Tento enrichmentový panel dokáže detegovať viac ako 280 respiračných patogénov, vrátane SARS-CoV-2 a ďalších vírusov, húb a baktérií a tiež viac ako 1 200 alel AMR.

Príprava samotnej NGS knižnice pozostáva zo syntézy cDNA z RNA, BLT („Bead-linked transposomes“) technológie – fragmentácia vlákna na magnetických guličkách a súčasné naviazanie adaptérov, tzv. tagovanie. Nasleduje vychytávanie oblastí záujmu, tzv. enrichment. Po pridaní indexov, normalizácii a kvantifikácii je knižnica pripravená na sekvenáciu. Súčasťou riešenia je aj softvér na analýzu dát, konkrétne IDbyDNA Explify Analysis Software, dostupný aj na BaseSpace Sequence Hub vo forme aplikácie IDbyDNA Explify RPIP Analysis App.

 

Základné špeficikácie k Illumina Respiratory Pathogen panelu:

  • Umožňuje detegovať RNA a DNA pre 187 baktérií, 53 húb a 42 vírusov
  • Identifikuje až 1 218 AMR alel
  • Poskytuje informáciu o celom genóme SARS-CoV-2 a Influenza A/ B vírusov
  • Zahŕňa próby cielené na 10 komerčne dostupných spike-in kontrol (fágy, vírusy, baktérie, syntetická RNA)
  • Flexibilné množstvo vtupného materiálu:  10 - 100 ng
  • Panel je kompatibilný so všetkými sekvenátormi spoločnosti Illumina
  • Doporučenie pre sekvenáciu: 1M čítaní/ vzorka
  • Využitím MiniSeq Rapid Reagent kitu trvá sekvenácia menej ako 5 hodín

 

Viac informácií sa dozviete na stránkach výrobcu

 

Zoznam targetov zachytávaných pomocou Illumina Respiratory Pathogen panelu:

  • Baktérie
  • Vírusy
  • Huby
  • AMR gény
Achromobacter denitrificans Dialister pneumosintes Neisseria meningitidis
Achromobacter xylosoxidans Dolosigranulum pigrum Neisseria mucosa
Acinetobacter baumannii Eikenella corrodens Nocardia abscessus
Acinetobacter lwoffii Elizabethkingia anophelis Nocardia arthritidis
Acinetobacter nosocomialis Elizabethkingia meningoseptica Nocardia beijingensis
Acinetobacter pittii Enterobacter cloacae complex Nocardia brasiliensis
Actinomyces graevenitzii Enterococcus faecalis Nocardia cyriacigeorgica
Actinomyces israelii Enterococcus faecium Nocardia farcinica
Actinomyces meyeri Escherichia coli Nocardia nova
Actinomyces naeslundii Eubacterium brachy Nocardia otitidiscaviarum
Actinomyces odontolyticus Eubacterium limosum Nocardia transvalensis
Aeromonas caviae Eubacterium nodatum Nocardia veterana
Aeromonas hydrophila Finegoldia magna Ochrobactrum anthropi
Aeromonas sobria Francisella tularensis Orientia tsutsugamushi
Aeromonas veronii Fusobacterium necrophorum Pandoraea pulmonicola
Aggregatibacter actinomycetemcomitans Fusobacterium nucleatum Pantoea agglomerans
Aggregatibacter aphrophilus Gemella haemolysans Parvimonas micra
Arcanobacterium haemolyticum Gemella morbillorum Pasteurella multocida
Bacillus anthracis Gordonia araii Pediococcus acidilactici
Bacillus cereus Gordonia bronchialis Peptostreptococcus anaerobius
Bacillus thuringiensis Haemophilus haemolyticus Prevotella buccae
Bacteroides fragilis Haemophilus influenzae Prevotella intermedia
Bartonella henselae Haemophilus parahaemolyticus Prevotella melaninogenica
Bartonella quintana Haemophilus parainfluenzae Prevotella pleuritidis
Bordetella bronchiseptica Haemophilus pittmaniae Proteus mirabilis
Bordetella hinzii Hafnia alvei Proteus penneri
Bordetella holmesii Kingella kingae Proteus vulgaris
Bordetella parapertussis Klebsiella aerogenes (Enterobacter aerogenes) Providencia stuartii
Bordetella pertussis Klebsiella oxytoca Pseudomonas aeruginosa
Bordetella petrii Klebsiella pneumoniae Pseudomonas fluorescens
Brucella abortus Klebsiella quasipneumoniae Pseudomonas stutzeri
Brucella canis Klebsiella variicola Ralstonia pickettii
Brucella melitensis Kytococcus sedentarius Raoultella ornithinolytica
Brucella suis Leclercia adecarboxylata Raoultella planticola
Burkholderia cepacia complex Legionella anisa Rhodococcus hoagii
Burkholderia gladioli Legionella feeleii Rickettsia rickettsii
Burkholderia glumae Legionella longbeachae Rothia mucilaginosa
Burkholderia mallei Legionella maceachernii Salmonella enterica
Burkholderia pseudomallei Legionella pneumophila Serratia marcescens
Burkholderia thailandensis Legionella wadsworthii Shewanella putrefaciens
Campylobacter concisus Leptospira interrogans Slackia exigua
Capnocytophaga gingivalis Leptotrichia buccalis Sphingomonas paucimobilis
Capnocytophaga leadbetteri Listeria monocytogenes Staphylococcus aureus
Capnocytophaga sputigena Moraxella catarrhalis Stenotrophomonas maltophilia
Cardiobacterium hominis Moraxella osloensis Streptococcus agalactiae
Cardiobacterium valvarum Morganella morganii Streptococcus anginosus
Chlamydia pneumoniae Mycobacterium avium complex Streptococcus constellatus
Chlamydia psittaci Mycobacterium fortuitum Streptococcus dysgalactiae
Chlamydia trachomatis Mycobacterium gordonae Streptococcus intermedius
Chromobacterium violaceum Mycobacterium kansasii Streptococcus mitis
Citrobacter freundii Mycobacterium malmoense Streptococcus pneumoniae
Citrobacter koseri Mycobacterium parascrofulaceum Streptococcus pyogenes
Corynebacterium diphtheriae Mycobacterium scrofulaceum Tatlockia micdadei (Legionella micdadei)
Corynebacterium jeikeium Mycobacterium szulgai Treponema denticola
Corynebacterium propinquum Mycobacterium tuberculosis Tropheryma whipplei
Corynebacterium pseudodiphtheriticum Mycobacterium xenopi Tsukamurella pulmonis
Corynebacterium pseudotuberculosis Mycobacteroides abscessus (Mycobacterium abscessus) Tsukamurella tyrosinosolvens
Corynebacterium striatum Mycobacteroides chelonae (Mycobacterium chelonae) Ureaplasma parvum
Corynebacterium ulcerans Mycobacteroides immunogenum (Mycobacterium immunogenum) Ureaplasma urealyticum
Coxiella burnetii Mycoplasma pneumoniae Veilonella parvula
Cronobacter sakazakii Neisseria flavescens Williamsia muralis
Delftia acidovorans Neisseria lactamica Yersinia enterocolitica
    Yersinia pestis
Coxsackievirus A Human parainfluenza virus 4
Coxsackievirus B Human parechovirus
Cytomegalovirus (CMV) Influenza A virus (H1N1)
EBV Influenza A virus (H3N2)
Enterovirus A71 Influenza A virus (H5N1)
Enterovirus D68 Influenza A virus (H7N9)
Herpes simplex virus 1 (HSV-1) Influenza A virus (H9N2)
HHV6 Influenza B virus
Human adenovirus B Influenza C virus
Human adenovirus C Measles Virus
Human adenovirus E MERS coronavirus (MERS-CoV)
Human bocavirus 1 Mumps virus
Human Coronavirus 229E Parvovirus B19
Human Coronavirus HKU1 Respiratory Syncytial Virus A
Human Coronavirus NL63 Respiratory Syncytial Virus B
Human Coronavirus OC43 Rhinovirus A
Human metapneumovirus Rhinovirus B
Human parainfluenza virus 1 Rhinovirus C
Human parainfluenza virus 2 Rubella virus
Human parainfluenza virus 3 SARS coronavirus
  SARS-CoV-2 
Alternaria alternata Lomentospora prolificans (Scedosporium prolificans)
Alternaria infectoria Microascus cinereus (Scopulariopsis cinereus)
Apophysomyces elegans Microascus cirrosus (Scopulariopsis paisii)
Aspergillus flavus Microasucus paisii (Scopulariopsis brumptii)
Aspergillus fumigatus Mucor circinelloides
Aspergillus nidulans Mucor indicus
Aspergillus niger Mucor racemosus
Aspergillus terreus Paecilomyces variotii
Aspergillus versicolor Paracoccidioides brasiliensis
Blastomyces dermatitidis Pneumocystis jirovecii
Candida auris Purpureocillium lilacinum
Cladophialophora bantiana Rasamsonia aegroticola
Coccidioides immitis Rasamsonia argillacea
Coccidioides posadasii Rhizomucor pusillus
Cryptococcus gattii Rhizopus azygosporus
Cryptococcus neoformans Rhizopus microsporus
Cunninghamella bertholletiae Rhizopus oryzae
Curvularia geniculata Saksenaea vasiformis
Curvularia lunata Sarocladium kiliense (Acremonium kiliense)
Exophiala dermatitidis Scedosporium apiospermum
Fusarium oxysporum Schizophyllum commune
Fusarium proliferatum Scopulariopsis brevicaulis
Fusarium solani Sporothrix schenckii
Fusarium verticillioides Syncephalastrum racemosum
Histoplasma capsulatum Talaromyces marneffei
Lichtheimia corymbifera Trichosporon asahii
Lichtheimia ramosa  
16S rRNA methyltransferase (A1408) IMP beta-lactamase
16S rRNA methyltransferase (G1405) IND beta-lactamase
AAC(2') KHM beta-latamase
AAC(3) KPC beta-lactamase
AAC(6') NDM beta-lactamase
ABC-F ATP-binding cassette ribosomal protection protein NmcA beta-lactamase
ANT(3'') OXA beta-lactamase
ANT(4') SCO beta-lactamase
ANT(6) SHV beta-lactamase
ANT(9) SME beta-lactamase
APH(2'') SPM beta-lactamase
APH(3') TEM beta-lactamase
APH(4) VIM beta-lactamase
ACC beta-lactamase Cfr 23S ribosomal RNA methyltransferase
ADC beta-lactamase with carbapenemase activity ciprofloxacin phosphotransferase
AIM beta-lactamase trimethoprim resistant dihydrofolate reductase dfr
BIC Beta-lactamase macrolide esterase
blaZ beta-lactamase Erm 23S ribosomal RNA methyltransferase
CARB beta-lactamase lincosamide nucleotidyltransferase (LNU)
CGB beta-lactamase MCR phosphoethanolamine transferase
CMY beta-lactamase macrolide phosphotransferase (MPH)
CphA beta-lactamase methicillin resistant PBP2
CTX-M beta-lactamase quinolone resistance protein (qnr)
DHA beta-lactamase sulfonamide resistant sul
GES beta-lactamase tetracycline inactivation enzyme
GIM beta-lactamase tetracycline-resistant ribosomal protection protein
GOB beta-lactamase glycopeptide resistance gene cluster
IMI beta-lactamase van ligase
Logo Illumina

Vyžiadať informácie o:

Respiratory Pathogen Panel

Monika Böhmerová Obchodná manažérka Genetica s.r.o. +421 908 708 999 bohmerova@genetica-group.com Genetica s.r.o.


Kontaktný formulár

Údaje s hviezdičkou
sú povinné
Copyright © 2023 GeneTiCA s.r.o. +421 907 373 757 | genetica@genetica.sk