MiSeq - Illumina

Systém MiSeq je najbežnejšie využívaným sekvenačným systémom v rámci metód NGS („next generation sequencing“). Vďaka jednoduchému a intuitívnemu pracovnému postupu predstavuje ideálnu platformu pre rýchle a nákladovo efektívne genetické analýzy.

Ako všetky sekvenačné systémy od spoločnosti Illumina, aj MiSeq funguje na princípe SBS („sequencing by synthesis“) technológie. Patentovaný reverzibilný terminátor umožňuje vysoko presné začlenenie a detekciu jednotlivých báz. Rôzne typy flow cell a rôzne možnosti dĺžky čítania zabezpečujú vysokú flexibilitu systému v závislosti od experimentálnych potrieb. Spomedzi rodiny Illumina sekvenátorov dokáže čítať najdlhší počet báz – až 2x300 bp. MiSeq dokáže vygenerovať až 15 Gb vysoko kvalitných dát, ktoré môžu byť analyzované lokálne využitím softvéru MiSeq Reporter alebo Local Run Manager alebo tiež vzdialene pomocou cloudej platformy BaseSpace Sequence Hub, ktorá tiež umožňuje monitoring experimentu, zdieľanie dát a slúži aj ako úložisko. Široké rozhranie aplikácií robí MiSeq jednou z najčastejšie sa vyskytujúcich stolových sekvenačných platforiem vo svetových laboratóriách. Má využitie pri sekvenovaní malých genómov, cielenom resekvenovaní, 16S metagenomike, amplikónovom sekvenovaní, predimplantačnom genetickom skríningu a pod.

Viac informácií nájdete na stránkach výrobcu: MiSeq

Délka čtení	Celkový čas	Výstup
1 x 36 bp	~ 4 hodiny	540-610 Mb
2 x 25 bp	~ 5,5 hodiny	750-850 Mb
2 x 150 bp	~ 24 hodin	4,5-5,1 Gb
2 x 250 bp	~ 39 hodin	7,5-8,5 Gb

Reading Passing Filtre
Jednostranné čtení	12-15 M
Oboustranné čtení	24-30 M

Quality scores
> 90% bazí vyšších než Q30 při 1 x 36 bp
> 90% bazí vyšších než Q30 při 2 x 25 bp
> 80% bazí vyšších než Q30 při 2 x 150 bp
> 75% bazí vyšších než Q30 při 2 x 250 bp

Délka čtení	Celkový čas	Výstup
2 x 75 bp	~ 21hodiny	3,3-3,8 Gb
2 x 300 bp	~ 56 hodiny	13,2-15 Gb

Reading Passing Filtre
Jednostranné čtení	22-25 M
Oboustranné čtení	44-50 M

Quality scores
> 85% bazí vyšších než Q30 při 2 x 75 bp
> 70% bazí vyšších než Q30 při 2 x 300 bp

MiSeq - Illumina

Súvisiace odkazy

MiniSeq - Illumina

MiSeq FGx - Illumina

Sekvenačné kity - Illumina

Vyžiadať informácie o:

MiSeq

Kontaktný formulár