•  
  • Technológie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
    Real-Time PCR Real-Time PCR
    10x Genomics 10x Genomics
  • Produkty
    Prístroje
    • Sekvenátory NGS
    • Skenery čipov
    • Sonikátory
    • Chromium X séria
    • Chromium Connect
    • Sonikátor M220
    • Sonikátor ML230
    • RT-PCR systém
    • Farbiace automaty
    • Xenium Analyzer
    Reagencie
    • PCR reagencie
    • RT-PCR kity
    • Sekvenačné kity
    • Kity pre prípravu NGS knižníc
    • Transfekčné činidlá
    • Illumina Long-Read Technológie
    Software
    • BaseSpace Sequence Hub
    • Illumina Connected Analytics
    • Local Run Manager
    • TruSight Software Suite
    • DRAGEN Bio-IT Platform
    Ostatné produkty
    • Repirátor N95
  • Diagnostika
    Real-Time PCR
    • Trombofilné mutácie
    • DIOS – priama detekcia SARS-CoV-2
    • EurobioPlex SARS-CoV-2 Multiplex
    • RealStar panel pre enterické ochorenia
    • RealStar panel pre respiračné ochorenia
    • RealStar panel pre imunodeficientných pacientov
    • RealStar panel pre tropické ochorenia
    • RealStar panel pre vírusy prenášané krvou
    NGS
    • Celogenómové sekvenovanie
    • VeriSeq
    • LymphoTrack
    • TruSight Myeloid Sequencing Panel
    • TruSight Hereditary Cancer Panel
    • Respiratory Pathogen Panel
    • AmpliSeq for Illumina Focus Panel
    • Illumina TruSight Cardio Sequencing Kit
    • Illumina TruSight Inherited Disease Sequencing Panel
    • Illumina TruSight One Sequencing Panels
    • TruSight Oncology 500
    • TruSight Tumor 15
    • Illumina Celoexómové sekvenovanie
    • Custom panely DNA/ RNA
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    • TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD)
    Microarrays
    • Kity pre čipové analýzy
    • Global Diversity Array (GDA Cyto) a Global Screening Array (GSA Cyto)
    Ostatné metódy
    • Antigénne testy na detekciu COVID-⁠19
    • Perinatálna diagnostika
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    Diagenode
    IAB
    IBA
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Thermo Scientific
    Verogen
    Vitrolife
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Obchodné oddelenie Obchodné oddelenie
    Aplikačná podpora Aplikačná podpora
    Servisné oddelenie Servisné oddelenie
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha
Úvod > Produkty > Reagencie > Kity pre prípravu NGS knižníc > Respiratory Virus Oligo Panel V2

Respiratory Virus Oligo Panel V2 - Illumina

Záujem o určenie subtypov SARS-CoV-2 neustále rastie, a preto i spoločnosť Illumina ponúka rôzne druhy riešení. Jedným z nich je využitie Respiratory Virus Oligo panelu v kombinácii s enrichmentovým prístupom založeným na Illumina RNA Library Prep with Enrichment, čo umožňuje výskumníkom získať sekvenačné dáta a tým zistiť subtypy nielen SARS-CoV-2 ale i potenciálnych pridružených koinfekcií zo skupiny respiračných vírusov. Na základe týchto dát je možné určiť zdroj infekcie či cesty prenosu.

Na základe cielenej „enrichment“ technológie umožňuje vysoko senzitívnu detekciu vírusov, ktorá nevyžaduje vysokú hĺbku čítania a slúži na rôzne analýzy evolúcie a prežívania vírusu. Kľúčovým prvkom protokolu sú panely s próbami, ktoré komplexne profilujú cieľové oblasti nevynímajúc vysoko mutagénne oblasti.

Vstupným materiálom protokolu je izolát RNA, ktorý je v prvom kroku prípravy knižnice prepisovaný do cDNA, následne prebiehajú kroky tagmentácie a „enrichmentu“. Samotné  sekvenovanie je možné na všetkých dostupných platformách Illumina. Súčasťou riešenia je i analýza dát. Na prípravu knižnice z extrahovanej RNA sa využíva Illumina RNA Prep kit with Enrichment, ktorý funguje na pricípe „Bead-linked“ tagmentácie. To znamená, že magnetické guličky nesúce na svojom povrchu enzýmy štiepia fragmenty a zároveň k nim napájajú potrebné adaptéry. Pre zacielenie na požadované oblasti nasleduje „enrichment“ krok využitím Illumina Respiratory Virus Oligo panelu V2. Po osekvenovaní knižnice využitím kompatibilného Illumina sekvenačného systému nasleduje spracovanie dát využitím aplikácie DRAGEN na detekciu patogénov a platformy IDbyDNA Explify.

 

              Library preparation                                                                 Enrichment

          

 

Základné špeficikácie k Illumina Respiratory Virus Oligo panelu:

  • obsahuje až 7 800 prób pre najčastejšie respiračné vírusy
  • obsahuje próby pre  ľudskú mRNA – pozitívna kontrola
  • umožňuje charakterizovať až 40 respiračných vírusov, vrátane SARS-CoV-2
  • možnosť kombinovať až 384 vzoriek v rámci 1 experimentu
  • flexibilné množstvo vtupného materiálu:  10 - 100 ng

 

Prehľad vírusov analyzovaných pomocou Illumina Respiratory Virus Oligo panelu:

Human coronavirus 229E Human metapneumovirus (CAN97-83)
Human coronavirus NL63 Human bocavirus 4 NI strain HBoV4-NI-385
Human coronavirus OC43 KI polyomavirus Stockholm 60
Human coronavirus HKU1 WU Polyomavirus
SARS-CoV-2 Human parechovirus type 1 PicoBank/HPeV1/a
Human adenovirus B1 Human parechovirus 6
Human adenovirus C2 Human rhinovirus A89
Human adenovirus E4 Human rhinovirus C (strain 024)
Human bocavirus 1 (Primate bocaparvovirus 1 isolate st2) Human rhinovirus B14
Human bocavirus 2c PK isolate PK-5510 Human enterovirus C104 strain: AK11
Human bocavirus 3 Human enterovirus C109 isolate NICA08-4327
Human parainfluenza virus 1 Influenza A virus (A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9))
Human parainfluenza virus 2 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99(H9N2))
Human parainfluenza virus 3 Influenza A virus (A/Texas/50/2012(H3N2))
Human parainfluenza virus 4a Influenza A virus (A/Michigan/45/2015(H1N1))
Respiratory syncytial virus (type A) Influenza B virus (B/Lee/1940)
Human Respiratory syncytial virus 9320 (type B) Influenza B virus (B/Wisconsin/01/2010)
Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)) Influenza B virus (B/Brisbane/60/2008)
Influenza A virus (A/Korea/426/1968(H2N2)) Influenza B virus (B/Colorado/06/2017)
Influenza A virus (A/New York/392/2004(H3N2)) Influenza B virus (B/Washington/02/2019)
Influenza A virus (A/goose/Guangdong/1/1996(H5N1)) Human control genes

 

Viac informácií nájdete na stránkach výrobcu

Respiratory Virus Oligo Panel V2
Logo Illumina

Vyžiadať informácie o:

Respiratory Virus Oligo Panel V2

Nikoleta Vargová Obchodná manažérka Genetica s.r.o. +421 907 675 727 vargova@genetica-group.com Genetica s.r.o.


Kontaktný formulár

Údaje s hviezdičkou
sú povinné
Copyright © 2023 GeneTiCA s.r.o. +421 907 373 757 | genetica@genetica.sk