BaseSpace je webová bioinformatická platforma, která slouží k online sledování kvality sekvenování, zpracování osekvenovaných dat (zarovnání k referenčnímu genomu, volání variant..) a v neposlední řadě ke sdílení výstupních dat z daného sekvenačního experimentu. BaseSpace je plně podporován sekvenační platformou typu MiSeq, NextSeq a HiSeq.
Zákazník si může zvolit před zahájením sekvenování, zda-li data budou vyhodnoceny pouze na sekvenační platformě nebo jej zároveň odešle na BaseSpace, kde proběhne paralelně jejich analýza. Výhodou odesílání dat na BaseSpace je nejenom jejich záloha a jednoduché sdílení, ale také využití on-line bioinformatických softwarů, které jsou k dispozici v rámci rozhraní BaseSpace. BaseSpace je provozován Amazon Web Servisem, který splňuje ty nejvyšší podmínky pro zabezpečení dat.
K dispozici jsou následující aplikace pro sekundární analýzu dat:
Dále je velikou výhodou, že lze stáhnout ukázková data ze všech typů sekvenačních platforem a kitů v záložce Public data.
Registraci k BaseSpace můžete provést zde.
Uživatelskou příručku si můžete stáhnout zde.