•  
  • Technológie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
  • Produkty
    Prístroje
    • Sekvenátory NGS
    • Skenery čipov
    • Sonikátory
    • Chromium X séria
    • Chromium Connect
    • Sonikátor M220
    • Sonikátor ML230
    • RT-PCR systém
    • Xenium Analyzer
    • Chromium platforma
    • Visium platforma
    Reagencie
    • Sekvenačné kity
    • Kity pre prípravu NGS knižníc
    • Chromium
    Nástroje pre analýzu dát
    • Profesionálna sekundárna analýza dát
    • Správa a analýza dát v cloude
    • Interpretácia variant v dedičných ochoreniach
    • Interpretácia variant v onkológii
    • Laboratórny informačný a manažérsky systém pre správu NGS aplikácií
    Ostatné produkty
  • Diagnostika
    Real-Time PCR
    • RealStar panel pre enterické ochorenia
    • RealStar panel pre respiračné ochorenia
    • RealStar panel pre imunodeficientných pacientov
    • RealStar panel pre tropické ochorenia
    • RealStar panel pre vírusy prenášané krvou
    NGS
    • TruSight Family
    • AmpliSeq for Illumina Focus Panel
    • Respiratory Pathogen Panel
    • LymphoTrack
    • Custom panely DNA/ RNA
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    • Celogenómové sekvenovanie
    • Rýchle sekvenovanie kompletného genómu (rWGS)
    • Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment
    Microarrays
    • Kity pre čipové analýzy
    • Global Diversity Array (GDA Cyto) a Global Screening Array (GSA Cyto)
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    DNA Diagnostic A/S
    IAB
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Pillar Bioscience
    Quantum-Si
    Seer
    SeqOne Genomics
    Yourgene Health
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Obchodné oddelenie Obchodné oddelenie
    Aplikačná podpora Aplikačná podpora
    Servisné oddelenie Servisné oddelenie
    GeneTiCA Experience Centre GeneTiCA Experience Centre
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha
Úvod > Aplikace > Illumina > Bioinformatika > BaseSpace

BaseSpace - Illumina

BaseSpace je webová bioinformatická platforma, která slouží k online sledování kvality sekvenování, zpracování osekvenovaných dat (zarovnání k referenčnímu genomu, volání variant..) a v neposlední řadě ke sdílení výstupních dat z daného sekvenačního experimentu. BaseSpace je plně podporován sekvenační platformou typu MiSeq, NextSeq a HiSeq. 

Zákazník si může zvolit před zahájením sekvenování, zda-li data budou vyhodnoceny pouze na sekvenační platformě nebo jej zároveň odešle na BaseSpace, kde proběhne paralelně jejich analýza. Výhodou odesílání dat na BaseSpace je nejenom jejich záloha a jednoduché sdílení, ale také využití on-line bioinformatických softwarů, které jsou k dispozici v rámci rozhraní BaseSpace. BaseSpace je provozován Amazon Web Servisem, který splňuje ty nejvyšší podmínky pro zabezpečení dat.

K dispozici jsou následující aplikace pro sekundární analýzu dat:

  • Resequencing
  • Targeted Sequencing
  • RNA-Seq
  • Small RNA
  • ChIP-Seq
  • Metagenomics
  • Variant Analysis
  • Quality
  • De Novo Assembly
  • Gene Fusion Detection
  • Methyl-Seq
  • Tumor Normal
  • Differential Expression
  • Visualisation

Dále je velikou výhodou, že lze stáhnout ukázková data ze všech typů sekvenačních platforem a kitů v záložce Public data.

 

Registraci k BaseSpace můžete provést zde. 

Uživatelskou příručku si můžete stáhnout zde. 

Súvisiace odkazy

Illumina Experiment Manager - Illumina

Variant Studio - Illumina

CASAVA

Logo Illumina

Vyžiadať informácie o:

BaseSpace

Údaje s hviezdičkou
sú povinné
Copyright © 2025 GeneTiCA s.r.o. +421 907 373 757 | genetica@genetica.sk