Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit (UPIP) - Illumina

Infekcie močových ciest sú jednou z najbežnejších bakteriálnych infekcií spôsobených Gram-pozitívnymi, ale i Gram-negatívnymi baktériami. Vo všeobecnosti zasahujú zväčša dolné močové cesty a sú častejším problémom u žien. Prekážkou úspešnej liečby je zvyšujúce sa percento antimikrobiálnej rezistencie medzi uropatogénmi.

Urinary Pathogen Panel (UPIP) je riešenie umožňujúce komplexnú detekciu a kvantifikáciu bežných, ale i tažko kultivovatelných a častokrát vynechávaných uropatogénov, pomáha tým kompletne  identifikovať profil infekcie. UPIP pokrýva rôzne druhy baktérií, húb, vírusov, parazitov a taktiež širokú škálu markerov antimikrobiálnej rezistencie. Protokol je založený na enrichmentovom prístupe, čo znamená, že pomocou špeciálne navrhnutných prób sú vychytávané cieľové oblasti genómu. Následné sekvenovanie prebieha na Illumina platformách. Odporúčané pokrytie je 1 milión čítaní na vzorku, tým pádom sa využívajú sekvenačné plaftormy kapacitne od MiniSeq-u vyššie. Po sekvenácií prebieha analýza dát využitím aplikácie Explify UPIP od IDbyDNA

Viac informácií nájdete na stránkach výrobcu