Při návštěvě webových stránek je velmi pravděpodobné, že stránka získá nebo uloží informace ve vašem prohlížeči a to ve formě souborů cookies. Nad soubory máte plnou kontrolu, ale jsou velmi důležité pro správné fungování webu. Mohou to být informace o vašich preferencích, zájmech o produkty, přizpůsobení prostředí a chování webu. V neposlední řadě obsahují data, která využíváme pro kontinuální zlepšování webu a našich služeb. Stále respektujeme vaše právo na soukromí, a proto se můžete rozhodnout, že se sběrem souborů cookies nebudete souhlasit.Nezapomínejte na to, že blokování některých souborů cookies můžete ovlivnit, jak stránka funguje a jaké služby jsou vám nabízeny.
TruSight Myeloid Sequencing Panel od spoločnosti Illumina obsahuje odborne definovaný obsah a overenú technológiu sekvenovania novej generácie (NGS) k identifikácii somatických variantov myeloidných malignít.
Obsah panela navrhlo konzorcium uznávaných odborníkov v oblasti hematologických malignít a je zameraný na gény často mutované pri nasledovných typoch ochorení:
TruSight Myeloid Sequencing panel pokrýva 15 celých génov (iba exóny) a 39 ďalších génov, ktorými sú pokrýté onkogénne hotspoty. Poskytuje komplexné hodnotenie kľúčových génov, o ktorých je známe, že sa podieľajú na myeloidných malignitách v jednom teste. Výsledkom je presné a nákladovo efektívne riešenie. Panel zachytáva cca 141 kB obsahu genómu a pozostáva z 568 amplikónov o dĺžke 250 bp navrhnutých v porovnaní s ľudským referenčným genómom NCBI37/ hg19. Tieto amplikónové knižnice je možné sekvenovať na stolových Illumina sekvenátoroch. Analýza dát môže prebiehať na lokálnom servri alebo na cloudovej platforme BaseSpace Sequence Hub využitím aplikácie TruSeq Amplicon App. Dáta vygenerované týmito softvérmi môžu byť importované priamo do Illumina VariantStudio Software App, ktorá umožňuje výskumníkom rýchlo identifikovať a klasifikovať varianty relevantné pre ochorenie. Intuitívne prostredie ponúka flexibilné možnosti filtrovania, jednoduchú klasifikáciu variantov, rýchlu a bohatú anotáciu a prispôsobiteľné tvorby reportov.
Základné špeficikácie k TruSight Myeloid Sequencing panelu:
Sekvenačný systém |
Max. počet vzoriek |
MiniSeq Mid-output |
2-3 |
MiniSeq High-output |
8 |
MiSeq v3 |
8 |
NextSeq 550 Mid-output |
48 |
NextSeq 550 High-output |
96 |
Zoznam génov:
ABL1 |
CEBPA |
HRAS |
MYD88 |
SF3B1 |
ASXL1 |
CSF3R |
IDH1 |
NOTCH1 |
SMC1A |
ATRX |
CUX1 |
IDH2 |
NPM1 |
SMC3 |
BCOR |
DNMT3A |
IKZF1 |
NRAS |
SRSF2 |
BCORL1 |
ETV6/TEL |
JAK2 |
PDGFRA |
STAG2 |
BRAF |
EZH2 |
JAK3 |
PHF6 |
TET2 |
CALR |
FBXW7 |
KDM6A |
PTEN |
TP53 |
CBL |
FLT3 |
KIT |
PTPN11 |
U2AF1 |
CBLB |
GATA1 |
KRAS |
RAD21 |
WT1 |
CBLC |
GATA2 |
MLL |
RUNX1 |
ZRSR2 |
CDKN2A |
GNAS |
MPL |
SETBP1 |
|