https://www.genetica.cz
+420 272 701 055
Služeb 4
Praha
3.png)
.png)
1.png)
1.png){kind=logo}
Microbiota Solution A/B - Arrow Diagnostics
Microbiota solution A/B sú súpravy určené na kvalitatívne hodnotenie ľudskej mikroflóry vychádzajúc zo vzoriek bakteriálnej genómovej DNA. Umožňujú identifikovať všetky bakteriálne druhy prítomné vo vzorke bez skreslenia selektívnym tlakom spôsobeným kultivačnými podmienkami v laboratóriu.
Obe riešenia sú certifikované (CE-IVD) na diagnostické využitie, zahŕňajú reagencie na prípravu 24 knižníc a taktiež bioinformatické spracovanie osekvenovaných dát. Príprava knižnice využitím týchto kitov je založená na amplifikácii hypervariabilných oblastí bakteriálneho génu 16S rDNA pomocou degenerovaných primerov v PCR reakcii („Polymerázová reťazová reakcia“), ktoré umožňujú identifikáciu väčšiny populácií baktérií prítomných v mikrobiote. Riešenie A pokrýva V1-V2-V3 hypervariabilné regióny, ktoré sú relevantné pri vzorkách slín, hlienu a kože. Riešenie B sa zameriava na V3-V4-V6 hypervariabilné regióny, ktoré sú podstatné pri analýzach urogenitálneho a črevného mikrobiómu. Sekvenácia pripravených knižníc prebieha na Illumina platformách (Tabuľka 1). Po sekvenovaní sa vzorky analyzujú automaticky pomocou špeciálneho softvéru MicrobAT od spoločnosti SmartSeq, ktorého možnosti pomáhajú klinikom identifikovať bakteriálne profily asociované s konkrétnymi patológiami a tiež identifikovať nové bakteriálne profily.
Tabuľka 1:
| Sekvenačný kit | Kat. číslo | Max. počet vzoriek v sekv. behu |
| MiSeq Reagent Kit v2 (500-cycles) | MS-102-2003 | 96 |
| MiSeq Reagent Nano Kit v2 (500-cycles) | MS-103-1003 | 12 |
