iScan - Illumina

Vysoko presný skener iScan od spoločnosti Illumina podporuje širokú škálu aplikácií ako genómové alebo cielené genotypovanie v genóme, metylačné profilovanie a cytogenetické analýzy.

Systém iScan využíva prokročilé laserové a optické komponenty zabezpečujúce submikrónové rozlíšenie a maximálnu priepustnosť. Výsledkom je vysoká rýchlosť skenovania bez straty kvality a reprodukovateľnosti údajov. Špeciálna Microarray technológia spoločnosti Illumina založená na báze guľôčok z oxidu kremičitého umiestnených v jamôčkach na povrchu čipu umožňuje analyzovať státisíce až milióny genotypov u jedného jedinca. Integrovaný softvér pozostávajúci zo špecifických modulov umožňuje rozsiahlu genetickú analýzu a interpretáciu dát.

Okrem samotného skeneru je potrebné si zaobstarať Infinium Starter Package, ktorý obsahuje všetko potrebné hardverové vybavenie pre prípravu daného čipu. Obsahuje napr. vysokorýchlostnú trepačku, hybridizačnú komoru, vákuovač, kompresor, špeciálne platničky, stojany, adaptéry a pod.

iScan umožňuje skenovanie naraz až 4 čipov. Podľa aplikácie môžu byť typy čipov naozaj rôzne, základne ich možno rodeliť na :

• Human genotyping – rýchla a nákladovo efektívna identifikácia mutácií a variantov v rôznych ľudských populáciách
• Plant and animal genotyping – BeadChip technológia určená pre genotypizáciu iných ako ľudských organizmov.
• Methylation genotyping – pre kvantitatívne skenovanie miest metylácie v celom genóme.Test Infinium Methylation Assay pokrýva CpG ostrovčeky, promótorové oblasti miRNA a ďalšie oblasti dôležité pri epigenetickej regulácii.

Viac informácií sa dozviete na stránkach výrobcu