GEM-X Technológia - 10x GENOMICS

GEM-X Technológia od 10x Genomics: Vyššia citlivosť, nižšie náklady a viac informácií z každej bunky

Spoločnosť 10x Genomics prináša na trh najnovšiu generáciu single-cell sekvenovania technológiu GEM-X. Táto inovácia spočíva hlavne v mikrofluidike a biochémii reagencií a posúva hranice možností v analýze jednotlivých buniek, ponúkajúc výrazné vylepšenia oproti predchádzajúcim generáciám.

Čo prináša GEM-X technológia?

GEM-X je výsledkom kontinuálneho vývoja lídra v single-cell analýze, pričom hlavné benefity pre výskumníkov sú:

• Vyššia citlivosť: Detekcia až o 98% viac génov na bunku: To umožňuje zachytiť aj nízko exprimované gény a vzácne bunkové typy (napr. neutrofily) s väčšou spoľahlivosťou (príklad https://shorturl.at/ECmTz).
• Efektívnejšie zachytenie buniek: Účinnosť zachytenia buniek sa zvyšuje na až 80%, čo je kritické pri práci so vzácnymi alebo limitovanými vzorkami (napr. biopsie, vzorky po flow sortingu).
• Nižšie náklady na analýzu: 30% zníženie nákladov na bunku vďaka optimalizovanému dizajnu mikrofluidných čipov a reagencií.
• Výrazne znížená tvorba multipletov: 2x nižší výskyt doubletov – iba 0,4% na 1 000 buniek – zvyšuje presnosť a dôveryhodnosť výsledných dát.
• Rýchlejší proces: Čas potrebný na vytvorenie emulzií (GEM) v čipe sa skracuje na 6 minút, čím sa zefektívňuje celý pracovný postup.

Technické parametre a vylepšenia

GEM-X je založená na výrazne prepracovanej architektúre:

• Nový dizajn mikrofluidných čipov: Umožňuje rýchlejšie a šetrnejšie vytváranie emulzií (GEM) pre bunky, poprípade jadrá.
• Univerzálna kompatibilita: Plne podporuje analýzu rôznych typov vzoriek – čerstvé bunky, mrazené bunky, izolované jadrá, aj vzorky z FFPE blokov.

Tabuľka: Kľúčové porovnanie výkonu GEM-X vs. Next GEM

Aplikácie GEM-X technológie

GEM-X je dostupná pre dve hlavné aplikácie, kdežto každá je prispôsobená špecifickým výskumným potrebám:

1. Chromium Single Cell 3' Gene Expression v4:
   • Komplexná analýza celého transkriptómu na úrovni jednej bunky.
   • Podpora multiomiky (súčasná detekcia génovej a proteínovej expresie pomocou Feature Barcode technológie).
   • Flexibilná priepustnosť: Spracovanie 500 – 20 000 buniek na vzorku.
   • Univerzálna druhová kompatibilita (človek, myš, ryby, rastliny, mikrobi atď.).
2. Chromium Single Cell 5' Immune Profiling v3:
   • Súčasná analýza 5’ génovej expresie a plnej sekvencie V(D)J repertoáru B a T lymfocytov.
   • Možnosť mapovania antigénovej špecifickosti pre výskum vakcín a imunoterapie.
   • Kompatibilita s CRISPR screeningom .

Prečo si vybrať GEM-X služby v GeneTiCA Group?

Sme oficiálnym partnerom spoločnosti 10x Genomics na Slovensku, Česku a Maďarsku a poskytujeme podporu šitú na mieru:

• Komplexnú podporu počas experimentu pomocou našej technickej podpory: Od konzultácie projektu, cez prípravu vzoriek (disociácia tkanív, príprava single-cell suspenzií pre FFPE/frozen vzorky), spracovanie na  Chromium X prístroji, až po predstavenie bioinformatického spracovania dát (Cell Ranger, Loupe Browser).
• Odborné poradenstvo: Pomôžeme vám vybrať optimálnu aplikáciu a riešenie (3’ vs. 5’).
• Poskytnutie služieb „na kľúč“ – ak by ste mali záujem, celý proces vieme urobiť za Vás od prípravy vzorky až po jej sekvenovanie, pričom Vy od nás obdržíte surové dáta. Následne Vám predstavíme softvéri a Vy sa môžete rozhodnúť, či si dáta spracujete sami, alebo si urobíme ďalšie stretnutie kde preberieme Vaše predstavy o výstupe a my Vám následne pripravíme ponuku na ďalšie bioinformatické pracovanie.

Chcete preskúmať nové možnosti single-cell výskumu s GEM-X?

Kontaktujte nás ešte dnes! Naše tím expertov je pripravený prebrať vaše projekty a nájsť najlepšie riešenie s technológiou, ktorá určuje smer v single-cell sekvenovania.