•  
  • Technologie
    NGS NGS
    Microarrays Microarrays
    Real-Time PCR Real-Time PCR
    Automatizace Automatizace
    Bioimaging Bioimaging
    Single Cell Analysis Single Cell Analysis
  • Produkty
    Přístroje
    • NGS sekvenátory
    • Příprava NGS knihoven
    • Fragmentace DNA
    • Microarrays
    • Bioimaging
    • Elektroforézy
    • PCR a Real-Time PCR
    • Automatické pipetovací systémy
    • Automatická extrakce NK
    Reagencie
    • NGS
    • PCR a Real-Time PCR
    • Transfekce
    Software
    • Software pro NGS
    • Bioinformatika
    Respirátory
    • Repirátor N95
  • Diagnostika
    Sekvenační kity
    • CleanPlex SARS-CoV-2 Panel
    • Respiratory Virus Oligo Panel
    • TruSight Cancer
    • TruSight Kardiomyopatie panel
    • TruSight One
    • TruSight Inherited Disease panel
    • VeriSeq
    • LymphoTrack
    Microarray readers
    Real-Time PCR
    • EurobioPlex SARS-CoV-2 Multiplex
    • Trombofilní mutace
    • STD
    • Detekce virů a kvantifikace virové nálože
    Ostatní metody
    • 2019-nCOV IgG/IgM Rapid Test
    • Perinatální diagnostika
    • Imunohistochemie
    • ISH HRP detekční kity
    • RISH a FISH
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Altona
    Biocare Medical
    C.B.S. Scientific Company
    Dynamiker
    Enzo Lifescience
    Eurobio Scientific
    Hamilton Robotics
    IAB
    IBA
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    IQ products
    Kimeery
    LGC Biosearch Technologies
    Mirus Bio
    Opentrons
    Paragon Genomics
    PCRmax
    Thermo Scientific
    Uvitec
    Vitrolife
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Aplikační podpora Aplikační podpora
    Technická podpora Technická podpora
    Molekulární biologie Molekulární biologie
    NGS NGS
    Automatizace Automatizace
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha
Úvod > Produkty > Software > Software pro NGS

Software pro NGS

Pro zpracovaní a analýzu dat z Next Generation Sequencing je nezbytnou součástí výkonný počítač či soubor počítačů – tzv. výpočetních klastrů. Výběr vhodného programu závisí na typu bioinformatické analýzy, kterou chceme provádět a možnosti nastavení softwaru pro práci na více procesorech. V neposlední řadě je velmi důležitá vhodná volba operačního systému, na kterém budou všechny bioinformatické a statistické analýzy provedeny. Jednou z možností je klasická volba OS Windows od Microsoft, kde uživatel může využívat nejenom jednoduchosti, ale také grafického rozhraní bioinformatických programů – tzv. GUI (Graphical user interface). Velikou nevýhodou je samozřejmě vysoká cena. Další z možností je volba méně známých, ale z výpočetního a cenového hlediska výhodných OS typu Linux či Mac. Zde převládá veliká výhoda nejenom z hlediska ceny, ale také široké škály dostupnosti programů pro analýzu a zpracování dat z NGS. Bohužel OS Linux odrazuje většinu uživatelů z důvodu absence GUI a nutnosti umět ovládat příkazovou řádku a také základy programování.

Illumina využívá jak OS Windows na platformě MiSeq či OS Linux na přístrojích NexSeq500 a vlajkové lodi, sekvenátoru HiSeq. 

 

Související odkazy

Illumina Experiment Manager - Illumina

Variant Studio - Illumina

BaseSpace - Illumina

CASAVA

MiniSeq - Illumina

Nejjednodušší stolní sekvenátor

MiSeq - Illumina

Sekvenování dostupnější než kdy jindy

MiSeq FGx - Illumina

První NGS systém pro forenzní genomiku

NextSeq 550 - Illumina

Kombinace skeneru čipů a vysokokapacitního sekvenátoru

Sekvenační kity - Illumina

Software pro NGS

Vyžádat informace o:

Software pro NGS

Údaje s hvězdičkou
jsou povinné
Copyright © 2021 GeneTiCA s.r.o. +420 272 701 055 | genetica@genetica.sk